Капелла Эмилиана является прекрасным примером очень нарядной и богато украшенной венецианской архитектуры начала XVI в., оставаясь при этом единственной ротондой этой эпохи в Венеции. Крученые колонны и двери-обманки, украшенные орнаментом, придают шестиугольной капелле вид игрушечного украшения, свойственный некоторым другим зданиям венецианского ренессанса. Наиболее ценными представителями этого стиля были архитекторы из Бергамо.

Интерьер церкви производит, на первый взгляд, немного мрачное впечатление, усиленное глубокой темной галереей хора. Кроме того, многочисленные повреждения, произведенные водой, подтверждают необходимость ремонта. При более близком рассмотрении угадываются тонкие мотивы архитектуры раннего Ренессанса. Капители колонн еще не повторяют формы античных образцов, как в эпоху позднего Ренессанса, но, подобно другим резным элементам, украшены тонкими растительными и геометрическими мотивами.

Сегодня Сан Микеле уже не является монастырем. Как и многие монастыри, он был закрыт при Наполеоне. Именно французский император повелел венецианцам убрать кладбища внутри города и хоронить отныне своих мертвых на острове Сан Кристофоро делла Паче, прилегавшем к Сан Микеле.

Уже издалека привлекают внимание белые фасады Сан Микеле. Церковь с ее благородным, скромным фасадом из истрийского известняка является первым архитектурным памятником Ренессанса Венеции. В 1469 г. Мауро Кодусси начал строительство монастырской церкви монахов-камальдуленцев, ставшей его первым архитектурным произведением. Сооруженная в 1530 г. шестиугольная капелла Эмилиана явно стремится перещеголять своим намного более роскошным убранством довольно сдержанный фасад церкви.