Почти одновременно с францисканцами в начале XIII в. в Венецию пришел другой орден нищенствующих монахов — доминиканцы. Мудрый дож Якопо Тьеполо (1229—1249) также наделил их земельной собственностью, которая должна была отдалить их от центра государственной власти — Пьяццы Сан Марко — на приличное расстояние. Еще большая дистанция отделяла место для сооружения церкви братьев св. Доминика от францисканцев, с которыми в течение столетий они нередко вступали в теологические разногласия. Кроме того, братья не встретили среди своих соседей могущественных меценатов, способных на бескорыстные пожертвования.

Ведь нищенствующие ордена полностью зависели от пожертвований населения. Крестовидная в плане церковь доминиканцев Сан Заниполо была построена в то же время, что и францисканская церковь Фрари. В 1234 г. началось строительство, которое закончилось только в 1430 г. Венецианское название готического храма «Заниполо» является типичным стяжением длинного «Санти Джованни э Паоло». Церковь посвящена этим двум римским мученикам III в.